用不同蛋白質分析方法鑒定玉米分泌蛋白組的比較研究

摘要：玉米根系在生長過程中向根際分泌蛋白質類大分子物質.采用雙向聚丙烯酰胺凝膠電泳-質譜技術,一維液相色譜-質譜聯(lián)用(LC/MS)和Shotgun三種不同鑒定方法對無菌條件收集的玉米根系分泌蛋白進行了分離、分析與鑒定,對3種鑒定方法在分泌蛋白分析中的應用做了詳細闡述和比較.結果表明,雙向電泳通過銀染可以看到200個蛋白質點,但由于蛋白量少,通過質譜無法對玉米根系分泌蛋白進行鑒定;用LC/MS鑒定得到了152個蛋白;用Shotgun技術鑒定得到了2 848個蛋白.LC/MS鑒定得到的蛋白全部出現(xiàn)在用Shotgun技術鑒定得到的2 848個蛋白中,后2種方法的結果可以互相驗證.Shotgun技術具有更高的靈敏性,更適合對蛋白質濃度低、干擾物多的植物根分泌蛋白組進行鑒定,能夠獲得完整可靠的信息. 作者： 馬瑋[1]Frank Hochholdinger[2]李春儉[1] Author： MA Wei[1]  Frank Hochholdinger[2]  LI Chun-jian[1] 作者單位： 中國農(nóng)業(yè)大學資源與環(huán)境學院,農(nóng)業(yè)部植物營養(yǎng)學重點開放實驗室,北京,100193Center for Plant Molecular Biology, Department of General Genetics, Eberhard Karls University Tuebingen, 72076 Tuebingen, Germany 期 刊： 光譜學與光譜分析   ISTICEISCIPKU Journal： SPECTROSCOPY AND SPECTRAL ANALYSIS 年，卷(期)： 2010, 30(10) 分類號： S123 關鍵詞： 玉米根系分泌物    分泌蛋白組    雙向電泳    LC-MS    Shotgun    MudPIT    機標分類號： TP3 S51 機標關鍵詞： 蛋白質類    分析方法    鑒定方法    玉米根系    分泌蛋白    蛋白組    比較研究    Techniques    Analyzing    Different    Identification of    Studies    Shotgun    雙向聚丙烯酰胺凝膠電泳    技術鑒定    LC/MS    質譜聯(lián)用    大分子物質    質譜技術    液相色譜 基金項目： 國家自然科學基金，國家自然科學基金委員會創(chuàng)新群體項目

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